Kies je voor de studierichting Natuurgeneeskunde, dan ligt de focus na het propedeusejaar op voeding, kruidengeneeskunde, iriscopie en diverse natuurgeneeskundige therapieën.
 
Filosofie en Ethiek van de Natuurgeneeskunde
De westerse filosofie, voorzover van belang voor de ontwikkelingen in de (natuur)geneeskunde, komt in kort bestek aan bod. Daarnaast is er aandacht voor de ethische aspecten van het beroep 'genezer'. Voorts wordt de student gestimuleerd een eigen visie op gezondheid, ziekte en genezing te ontwikkelen.

Algemene natuurgeneeskunde
Naast de natuurgeneeskundige diagnose zoals de homotoxicoseleer van Reckeweg, de anamnese en de Mayr-diagnostiek komt een breed scala van natuurgeneeskundige therapieën en technieken aan bod, zoals hydrotherapie, vasten- en reinigingskuren, symbionten-therapie, huidstimulerende behandelingen enz.
De taak van de natuurgeneeskundige ligt in de begeleiding van de mens, zowel lichamelijk als geestelijk, wanneer deze geconfronteerd wordt met ziekte of anderszins is vastgelopen in zijn ontwikkelingsproces.

Esoterie
In dit vak maakt de student kennis met een holistische visie. Hij leert energetische processen te herkennen en bewust toe te passen in de eigen leefwereld.

Metaforen
De holistische visie wordt hier verder uitgewerkt. Hoe kan men nu in de praktijk op een verantwoorde wijze de verbanden tussen geest en lichaam ontdekken? Hoe kunnen deze inzichten vervolgens de cliënt helpen zijn ziek-zijn te begrijpen en hoe kunnen voorts deze inzichten richting geven aan het behandelingsplan? Er wordt veel gebruik gemaakt van casuïstiek. (Dit vak is ook onderdeel van de domeinen klassieke homeopathie en counseling – manuele therapieën.)

Voedingsleer
De voedingsleer is een belangrijke pijler onder de natuurgeneeskunde. De voedingsstoffen zoals eiwitten, vetten, koolhydraten, vitamines en mineralen worden uitgebreid behandeld. Diverse alternatieve voedingssystemen komen aan bod. Er wordt verder veel aandacht besteed aan voeding in de diverse leeftijdsgroepen en bij verschillende ziekten.

Fytotherapie / Botanie
De fytotherapie (of kruidengeneeskunde) geniet een groeiende belangstelling bij wetenschap en publiek. Tijdens de opleiding worden ongeveer 120 kruiden uitgebreid behandeld. Daarbij gaat het om onder meer de werkzame stoffen, de uiterlijke signatuur, kleur en groeiwijze en toepassingsmogelijkheden.
Daarnaast wordt in de practica lessen gewerkt met levende kruiden in de natuur. Ze worden geduid volgens de signatuurleer en men leert hoe ze gebruikt kunnen worden (onder andere zelf zalven en tincturen maken). Regelmatig vinden de lessen plaats in één van de mooiste kruidentuinen van Nederland (Thijsse's Hof te Bloemendaal) of in een natuurgebied.

Iriscopie
Iriscopie of irisdiagnose is een methode om snel en efficiënt een diagnose te stellen. Het idee achter iriscopie is dat de iris (het regenboogvlies) als 'monitor' van de hersenen een bijna volledig beeld geeft van de lichamelijke en geestelijke toestand van de gehele mens. 
Aan de hand van tekens, kleuren en plooien wordt eerst een verband gelegd met het fysieke deel van de mens: welke organen zijn aangedaan, waar zitten de zwakke plekken en dergelijke? Daarna wordt nagegaan hoe de mens in het algemeen reageert op de omgeving, wat zijn karakter en reactiepatroon is en welke achtergronden de gevonden afwijkingen psychologisch hebben. Pas dan kan gezocht worden in welke richting een eventuele therapie moet gaan.